【项目动态】博奥晶典参与制定的团体标准《血流感染病原体核酸高通量测序技术应用指南》正式发布实施

团体标准
近日,博奥晶典旗下北京博奥医学检验所有限公司参与起草的团体标准T/CITS 687—2025《血流感染病原体核酸高通量测序技术应用指南》正式发布,成为国内首个血流感染领域覆盖mNGS/tNGS 双技术路线的全流程应用规范。
该标准由中国医学科学院北京协和医院牵头,联合多家权威机构共同起草,博奥晶典作为标准参编单位之一,全程参与标准编制工作。

《血流感染病原体核酸高通量测序技术应用指南》围绕mNGS、tNGS两大测序技术,从实验流程体系建立、生信分析流程建立、性能确认、质量控制及应用场景等方面统一规范,适用于医疗机构实验室、疾病预防控制机构对血流感染病原体核酸高通量测序的应用,进一步推动了推动mNGS、tNGS技术在血流感染测序检测走向标准化、规范化。
主要起草单位:中国医学科学院北京协和医院、中国科学技术大学附属第一医院(安徽省立医院)、复旦大学附属华山医院、南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)、中南大学湘雅二医院、中国食品药品检定研究院、中日友好医院、上海交通大学医学院附属仁济医院、中山大学孙逸仙纪念医院、中山大学附属第一医院、北京博奥医学检验所有限公司、西安大兴医院、西安市红会医院、湖北文理学院附属襄阳市中心医院等。
病原宏基因组高通量测序(mNGS)
一、实验流程体系建立
规范血浆样本从标本采集→核酸提取→文库构建→上机测序全链条标准化操作,为实验室搭建mNGS平台提供硬性操作准则。
1. 标本管理:优先采用EDTA抗凝管或游离核酸专用保存管采血,采血后轻柔颠倒混匀8~10次避免溶血;2~8℃、1600g离心10min分离血浆;样本 2~8℃短期保存≤24h,长期储存≤-20℃,转运使用生物安全箱,禁止反复冻融。
2. 核酸提取:每批次实验同步设置阴、阳性质控品,临床应用前需要进行性能验证/确认,设置总质量或者核酸浓度最低要求,未达到需要重提或者重新采样。
3. 文库与测序:区分DNA、RNA文库构建方案;文库浓度<0.5ng/μL需复检;依据文库摩尔浓度均衡混样上机,明确血液样本类型最佳测序数据量。
二、生信分析流程建立
1. 数据质控底线:测序碱基质量Q30≥85%,去宿主后有效序列>1×10⁷条(10M)。
2. 分析步骤:原始数据去接头→剔除人类宿主序列→病原数据库比对→物种注释。
3. 判读规则:常规病原结合阴性对照、背景核酸剔除污染序列;未知/新发病原不受序列阈值约束,依托同源比对佐证;严格遵循:阳性≠感染、阴性≠排除、区分致病菌/定植 / 污染三大判读原则。宜结合临床病史、实验室检查结果、影像学结果等,对mNGS检测结果进行综合分析和解读。
三、性能确认
企业参考品:至少包括阴参、阳参、LoD 检出限参考品、精密度参考品。
生信分析流程参考盘性能确认:包括但不限于:近缘物种的相互交叉干扰率评估和分析流程的灵敏度和特异性评估。
性能确认内容包括:检出限、重复性、内源干扰(血脂/ 胆红素 / 溶血)、抗菌药物外源干扰、近缘菌交叉反应、样本保存/冻融稳定性、准确度(对标血培养 /qPCR)等。
四、质量控制
搭建全流程闭环质控,覆盖样本接收拒收、试剂批次、核酸、文库、测序上机、生信数据库、报告复核全节点;明确不合格样本让步检测流程、复测规范,从全链条管控检测误差。
五、mNGS应用场景
宜进行血液mNGS 检测的应用场景包括但不限于:a)疑似新发病原体、罕见病原体引起的血流感染,传统技术反复检测无法明确致病微生物;b)疑似继发性血流感染且原发感染灶的病原学检测为阴性,或因各种因素无法送检原发感染灶样本;c)疑似血流感染的重症患者或免疫抑制患者存在混合感染可能;d)疑似血流感染的患者,血培养3天未检出病原体且经验性抗感染治疗无效。
靶向高通量测序(tNGS)
一、实验流程体系建立
样本前处理、核酸提取标准完全沿用mNGS规范,仅在建库、测序参数差异化管控:分为扩增子、杂交捕获2种建库路线;文库<1ng/μL需复检;测序数据下限:杂交捕获≥1M有效reads,扩增子≥0.1M有效reads。
二、生信分析流程建立
宜过滤掉测序接头和低质量序列,将获得的高质量读长序列作为微生物鉴定的输入数据。宜建立适用于tNGS分析流程的宿主数据库和微生物数据库。
解读需兼顾扩增效率不均、实验污染带来的假阳/假阴,必须结合临床信息综合判读。
三、性能确认
验证框架对标mNGS,宜验证靶标范围至少覆盖各种类别(细菌、真菌、病毒、寄生虫等)。
四、质量控制
全流程基础质控复用mNGS标准。
五、tNGS应用场景
tNGS应用场景包括但不限于:a)非重症患者、血常规及感染指标(如 CRP、PCT等)较高的患者,送检血培养的同时,宜送a检血液tNGS检测;b)对于疑似常见真菌性血流感染患者,送检血培养的同时,宜启动真菌血清学和血液tNGS检测;c)对于疑似tNGS靶标范围内的病原体感染引起的血流感染患者,宜送检血液tNGS检测;d)对于可能由耐药菌感染引起的血流感染患者,宜送检具有相应耐药基因靶标的血液tNGS检测;e)tNGS结果阴性,且临床仍高度怀疑血流感染时,宜送检mNGS。
博奥晶典以技术实力定义行业标准作为本次团体标准的核心起草单位之一,博奥晶典旗下北京博奥医学检验所深度参与标准的框架搭建、条款研讨、技术验证与内容修订工作。依托多年感染性疾病分子诊断领域的技术积淀、丰富的临床落地经验以及成熟的mNGS、tNGS双技术平台,博奥将一线临床检测痛点、实验室质控经验、技术创新成果充分融入标准条款,让标准更贴合临床实际、更具落地性、更适配国内医疗场景。


长期以来,博奥晶典深耕病原高通量测序领域,搭建了完善的全流程质控体系、专业的生信分析平台和标准化检测实验室,可精准覆盖血流感染各类常见、疑难、罕见病原体,兼顾检测效率与精准度。此次参编国家级行业团标,既是行业对博奥技术实力、质控能力与临床服务水平的高度认可,也彰显了博奥在感染精准诊断领域的行业引领力。
